本发明公开了一种掺锰硅羟基磷灰石纳米线生物陶瓷，其化学组成通式为Ca10‑xMnx(P1‑ySiyO4)6(OH)2，0＜x≤1，0.05≤y≤0.12，纳米线的长度为0.1μm～1.3μm，直径为10nm～30nm。上述纳米线生物陶瓷的制备方法包括如下步骤：S1、制备化学组成通式为Ca6‑xMnx(Si6O17)(OH)2的掺锰硬硅钙石纳米线；S2、制备化学组成通式为Ca10‑xMnx(P1‑ySiyO4)6(OH)2的掺锰硅羟基磷灰石纳米线；S3、将纳米线烘干，得到掺锰硅羟基磷灰石纳米线生物陶瓷。本发明综合羟基磷灰石纳米材料及锰、硅元素的免疫调控及促成骨特性，调整材料的组成和材料的制备方法，得到具备纳米线形貌及锰、硅元素的掺锰硅羟基磷灰石纳米线生物陶瓷，应用于骨缺损修复。