本发明公开了一种不完全信息的配电网高容错故障研判方法，包括如下步骤：步骤1)：采集电网公司的网架信息与历史故障数据信息；步骤2)：根据步骤1)中的配电网的三相电压幅值信息，实行配电网拓扑结构变动检测的启动条件，对拓扑结构变动的关键性特征进行深入挖掘，实行三种研判数据，并采用模糊集理论进行三相电压幅值信息不完全情况下的配电网拓扑结构识别；步骤3)：将步骤1)中的故障三相电流信息处理生成健全数据集与不健全数据集，基于这两个数据集来训练具有信息补全功能的图神经网络；步骤4)：模型训练完毕后，输入配电网的实时故障数据进行故障诊断并根据完整信息进行故障研判，本发明的有益效果：对不完全信息下的配电网故障准确的研判。