本申请公开了一种综合能源系统的运行方法及装置，该方法包括：根据直接分位数回归预测算法，对综合能源系统的光伏发电站历史数据进行处理，得到光伏发电功率的预测值；根据预测值，构建光伏发电功率的累计概率分布函数；将置信水平设置为备用余量的约束条件，根据累计概率分布函数和约束条件对光伏功率进行约束，以得到电力系统的安全运行参数；根据安全运行参数、热能参数、气量参数和综合能源系统包括的储能设备的运行参数，构建综合能源系统模型；根据运行目标函数对综合能源系统模型进行优化，得到多目标优化问题模型；根据加权系数法进行求解，得到运行控制策略。通过本申请提供的方法，能够提供符合综合能源系统的实际需求的运行控制策略。