本发明提供了一种基于数据驱动的系统运行效率估算方法、装置及介质，包括：获取三联供系统的耗气量；将所述耗气量分别带入预先构建的三联供发电效率和供热效率的拟合函数中，得到三联供发电效率估计值和供热效率估计值；其中，所述三联供发电效率和供热效率的拟合函数是基于三联供系统历史运行数据计算的三联供历史发电效率、历史供热效率和耗气量采样最小二乘法拟合得到的。本发明采用三联供系统历史运行数据结合最小二乘法拟合得到的三联供发电效率和供热效率的拟合函数估算三联供发电效率和供热效率，相比于现有技术直接采用铭牌数据估算的结果更加准确。