本发明公开了一种公共厕所用粪便自动降解装置及其使用方法；本发明包括箱体、设置于箱体内部粪便搅拌组件、设置于箱体表面的粪便分离组件和设置于箱体表面的底板，转轴表面均配合连接有两组搅拌桨，两组搅拌桨以相反方向转动使箱体中的物料呈径向环向轴向三向运动，通过搅拌桨搅拌对物料进行混合分解，分解后极少量余渣富含有机质N、P、K和微量元素，可回收为高效有机肥料；同时包含着大量好氧微生物的高效生物活性填料可将粪尿中的臭气吸收转化，实现了对粪便的分解、脱臭、净化一体化处理。而粪尿中的大肠杆菌、寄生虫卵等有害病菌及杂菌在60℃以上高温条件下被杀死或被微生物群落吞噬，从而实现安全卫生无害化处理。