本发明涉及一种基于射频增益可调的导航接收机及其抗干扰方法，所述方法包括：阵列天线获取各通道的卫星信号；初始化射频增益，射频通道对所述卫星信号进行滤波、放大和混频至模拟中频信号；对各通道的模拟中频信号进行AD采样、数字下变频、滤波和下抽处理至基带信号；对所述基带信号进行干扰监测，计算所述射频通道的射频增益并写入所述射频通道；根据干扰监测结果和导航定位解算，计算抗干扰滤波器；所述抗干扰滤波器对所述基带信号进行干扰滤波，得到干扰抑制后的信号。本发明可以有效改善因AD采样消顶无法抑制干扰的问题，提升导航接收机的抗干扰强度，保证低干扰条件下卫星信号正常接收的同时实现强干扰条件下信号采样的不失真。