本发明提供了一种原液着色超细纤维用过氧化物交联改性超分散色母粒及其制备方法和应用，该方法中，将颜料与润湿剂润湿混合后，加入过氧化物交联剂及基体树脂，进行充分混合后，加入挤出机中挤出造粒，得到超细纤维用原液着色超分散色母粒。该色母粒具有颜料粒度小、颜料分散性好的优点，色母粒中颜料粒径可达到微纳米级别，颜料粒径小于1微米，色母粒可纺性优良。且该色母粒应用于纤维着色中，有效避免了后续织物印染产生废水的问题，达到节能环保的目的。