本发明属于药物开发技术领域，具体涉及一种高尿酸血症肾脏病致病因子预筛选方法、系统和存储介质。本发明的方法包括如下步骤：步骤1，对高尿酸血症肾脏病动物模型进行检测；步骤2，根据步骤1的检测结果分析转录因子是否为致病因子；其中，确定因子为致病因子的标准是满足如下四个条件：1）所述因子在重组TAD中受增强子调控；2）所述因子通过生物标志物环与增强子相互作用；3）所述因子及其增强子与生物标志物结合；4）所述因子高表达。本发明还提供了实现上述方法的系统。本发明的方法效率和准确度高，在药物开发等领域中具有很好的应用前景。