本发明提供一种基于陷波滤波器和补偿器的中点电位平衡控制方法，属于变流器技术领域，包括：确定三电平变流器直流侧的正中母线电容电压信号和中负母线电容电压信号的差值信号，并将所述差值信号输入陷波滤波器进行处理；将处理后的差值信号作为负反馈信号与零参考信号共同输入补偿器；将补偿器输出信号除以特定的比例系数作为零序调制信号叠加到当前变流器的三相调制信号中，并根据叠加零序调制信号的三相调制信号生成PWM信号，控制三电平变流器直流侧中点电位平衡；本发明采用陷波滤波器和补偿器生成零序调制信号，并叠加到三相交流调制信号上，从而控制中线上的电流，可解决三电平变流器直流侧电容中点电位不平衡的问题。