本发明公开的基于复合零序导纳偏离度的单相接地故障选线方法及系统，当系统出现单相接地故障时，获取系统的中性点偏移电压；根据线路的零序电压、零序电流和中性点偏移电压，获取各线路的零序导纳，将各线路的零序导纳累加获得线路的复合零序导纳；提取线路的复合零序导纳幅值，及系统出现单相接地故障前后线路的复合零序导纳相角变化量，并计算复合零序导纳幅值偏离度指标与相角偏离度指标；根据幅值偏离度指标，对故障线路进行初步筛选，根据相角偏离度指标对初步筛选出的故障线路进行复核，确定最终的故障线路。提高了单相接地故障选线的准确性。