本发明属于高分子材料技术领域，具体涉及一种双组分聚氨酯结构胶及其制备方法和应用。本发明的双组分聚氨酯结构胶，包括A组分和B组分，所述A组分包括如下重量份的组分：NCO封端的聚氨酯预聚体10～40份；多亚甲基多苯基多异氰酸酯0～30份；导热填料A 50～80份；除水剂A 1～4份；所述B组分包括如下重量份的组分：蓖麻油多元醇5～30份；芳香族聚醚多元醇2～20份；非卤化磷多元醇1～10份；醛酮树脂1～8份；导热填料B 50～80份；除水剂B 1～3份。本发明的结构胶选用恰当的原料以及科学的配比，得到的结构胶具有高粘结强度、高导热性能、以及低密度的特点，可应用于电池的组装。