本发明属于面粉生产技术领域，特别涉及一种面粉副产品的水分控制系统及水分控制方法，包括在副产品生产线末端增加的加湿斗，所述加湿斗内均匀设置若干个雾化喷头，所述雾化喷头通过连接管连接供水系统，所述连接管上设有电磁阀，所述加湿斗依次连接检查筛和中间计量称，副产品进入加湿斗内，所述雾化喷头通过供水系统给加湿斗内的副产品喷雾加湿，加湿后的副产品进入检查筛内，检查筛对副产品进行筛理，合格的面粉穿过筛孔经过中间计量称，中间计量称用于在线流量的测定，随后对副产品进行人工取样，人工通过化验设备对取样的副产品进行湿度测定，根据湿度测定值，控制供水系统的供水量大小，使副产品的湿度达到目标值。