本发明公开了一种用于分布式电源接入的区域电网故障自愈控制方法及系统，本发明方法包括在区域电网发生故障且存在分布式电源时，计算分布式电源的容量和负荷的视在功率之间的比值K且在超出边界时：切除全部的分布式电源，等待自愈装置的动作条件被满足，满足后故障自愈装置动作以将发生故障后的区域电网接入备用电源,并根据约束条件逐级恢复被切除的负荷和分布式电源。本发明不仅具备快速的故障后恢复能力，同时大大减少了停电时间和停电范围，提高了电网的稳定性，通过对故障后分布式电源与负荷容量的比值进行分析，针对不同的源荷比例采取不同的故障自愈控制策略，在保证了故障恢复的选择性、可靠性的前提下同时提高了故障恢复的快速性。