本发明公开了一种实现云原生存储数据高可用的方法及系统，属于云原生领域；所述的方法具体步骤如下：S1在kubernetes集群中提供存储服务的节点上安装云原生存储的控制面pod，pod中的主体编译的二进制通过二进制链接ZFS相关库；S2编译的二进制调用处理程序，在内核空间ZFS情况下使用zpool/zfs、CLI二进制文件；S3开发逻辑对事务性的池化处理层进行任务执行；S4在用户空间内以二进制文件形式实现创建配置池和ZFS卷模拟器；S5使用unix域套接字执行IOCTL重定向的做法；S6在用户空间支持ZFS卷模拟器的任务；S7定义资源CRD，以operator模式提供和使用者的交互界面；本发明以云原生的方式提供高可用存储能力，将Kubernetes工作节点可用的存储资源转换为分布式Kubernetes持久卷，从而对接Kubernetes有状态工作负载。