本发明涉及一种多收缩孔径玻璃毛细管的加工装置及加工方法。加工装置包括基座及设在基座上的驱动机构、滑动部件、导轨、夹持部件和加热部件；在对待加工毛细管进行加工时，采用夹持部件将待加工毛细管夹持固定，通过加热部件对指定部位加热，通过驱动机构带动夹持部件移动，以实现对多个指定部位的拉伸，得到多收缩孔径的玻璃毛细管。加工方法为将待加工毛细管穿设于加热部件中，并将其两端固定；通过加热部件对待加工毛细管的指定部位加热；通过两夹持部件往相反方向移动，使得待加工毛细管被双向拉伸，可得到多收缩孔径的玻璃毛细管。本发明能将玻璃毛细管加工成多收缩孔径结构。