本发明公开了一种水性磺酸盐聚酯及其制备方法和应用，所述磺酸盐聚酯的制备原料包括二元醇、二元酸；所述二元醇包括无支链结构的二元醇、具有脂环结构的二元醇中的至少一种；所述二元酸包括含磺酸基二元酸或其酯、芳香族二元酸。本发明中的磺酸盐聚酯的制备过程中未使用溶剂，具有环境友好的特点，符合当前所提倡的环保理念，且避免了中和剂的使用，本发明中以脂肪族二元醇作为软段，芳香二元酸作为硬段，通过调节制备磺酸盐聚酯的单体种类和含量，得到不同的分子结构，制备得到的磺酸盐聚酯的玻璃化转变温度可调控，且使用磺酸盐聚酯分散液制备的色浆具有较好的分散稳定性。