本发明公开了一种相位与周期可动态变换的PWM输出电路，包括：自动重载寄存器、比较寄存器、计数器、比较器模块以及计数模式控制输出模块。自动重载寄存器包括第一预装载寄存器和第一影子寄存器。比较寄存器包括第二预装载寄存器和第二影子寄存器。比较器模块包括第一比较模块、第二比较模块、第三比较模块和第四比较模块。本发明的相位与周期可动态变换的PWM输出电路，在更新事件发生时，动态切换控制PWM信号的相位、周期的改变和更新，具有在PWM输出电路工作时，输出PWM信号的频率和占空比可动态编程变化和切换的特性，以及PWM信号切换相位时的中断标志位的控制产生。