本发明提供一种机柜空调器及其控制方法，其中的机柜空调器，包括：壳体和分隔件，分隔件安装在壳体内，且将壳体内的空间分隔为第一独立空间和第二独立空间，分隔件内具有容纳空腔，分隔件朝向第一独立空间的侧面上设置有第一风阀，第一风阀用于控制容纳空腔与第一独立空间连通与否，第一独立空间内安装有内风机。根据本发明，当机柜空调器在外界温度较低的情况下运行时，通过打开第一风阀，开启内风机运行，则在内风机风力的带动下，第一独立空间内的热风会被吹进容纳空腔内，使得处于第一独立空间和容纳空腔之间的分隔件的壁体的左右两侧的温差显著缩小，从而防止分隔件朝向第一独立空间的侧面上产生冷凝水。