本发明混合电池领域，用于解决现有的混合电池中的蓄电池和超级电容之间的储能能源不能进行合理的分配，而且蓄电池、超级电容器发生故障时易于造成安全隐患的问题，具体涉及一种超级电容混合电池的储能能源分配系统及其方法；该储能能源分配系统包括数据采集模块、处理器、能源分配模块、能源分配模块以及状态检测模块；该储能能源分配系统采用超级电容器进行辅助供电，可以根据蓄电池和超级电容器蓄余比、容余比对两者的供电量进行合理分配，使得蓄电池和超级电容器中的电量得以充分利用，还对蓄电池的输出电流进行监控，能够对蓄电池进行保护，降低蓄电池损耗。