本发明公开了一种四价流感病毒亚单位疫苗制备摇动混合系统，包括摇动底座，所述摇动底座上固定安装有竖支架，且摇动底座上设置有斜坡槽，所述竖支架上固定安装有加强筋，且竖支架和加强筋之间固定安装有分层板，所述竖支架上固定安装有弹簧杆，且弹簧杆上滑动安装有挂件，所述挂件固定连接在活动板上，所述活动板上设置有多级推动结构，所述分层板上固定安装有限位座，且限位座中滑动安装有滑杆，所述滑杆上固定连接有减震顶板以及三角块所述摇动底座上安装有具有双侧同步控制功能的顶压结构；本发明的摇动混合系统用于加速病毒的灭活过程，可以进行病毒罐的摇动，并由上至下可以逐渐的减小幅度，不易造成病毒过度灭活。