本发明提供一种智慧环保监测数据处理方法及系统，根据污水氨氮浓度值以及预设氨氮转化率的乘积，得到标准亚硝态氮浓度值，基于标准亚硝态氮浓度值、污水体积、预设硝化反应时长生成硝化菌菌落数量；在硝化反应池添加硝化菌菌落数量，根据预设硝化反应时长对预设时间段内进水管处污水进行处理，得到第一水体；根据第一亚硝态氮浓度值与第一氨氮浓度值的比值，生成第一比值；若第一比值处于预设比值区间内，则控制旁支管道处的旁支阀门关闭、总管道处的总阀门打开，并根据第一比值、第一水体体积、预设反硝化反应时长生成反硝化菌菌落数量；在反硝化反应池中添加反硝化菌菌落数量，并根据预设反硝化反应时长对第一水体进行处理，得到第二水体。