一种通过硅藻土的投加快速启动短程反硝化耦合厌氧氨氧化生物脱氮的装置和方法，属于污水处理领域。装置包括：城市生活污水原水箱、硝酸盐废水水箱、短程反硝化耦合厌氧氨氧化反应器。本方法通过向短程反硝化耦合厌氧氨氧化反应器内投加硅藻土，利用硅藻土改善短程反硝化耦合厌氧氨氧化反应器内活性污泥的沉降性能，同时为短程反硝化厌氧氨氧化菌的生长提供良好载体，加速短程反硝化耦合厌氧氨氧化反应器内颗粒污泥的形成。通过投加硅藻土加速颗粒污泥的形成，有助于避免污泥上浮而流失，同时有助于短程反硝化菌与厌氧氨氧化菌共生富集，快速启动短程反硝化耦合厌氧氨氧化反应器，从而降低处理能耗并提高短程反硝化耦合厌氧氨氧化反应器稳定性。