本发明公开了一种绝缘油过滤系统及过滤方法，用于解决现有绝缘油过滤系统通过人工进行操作，自动化程度低的问题。该绝缘油过滤系统包括滤油机、N个第一油罐组件、第二油罐组件和控制装置。每个第一油罐组件中的第一油罐分别通过第一阀门、第二阀门与滤油机的第一进油口、第一出油口连通；第二油罐组件中的第二油罐分别通过第三阀门、第四阀门与滤油机的第一进油口、第一出油口连通；第一液位检测仪器、第二液位检测仪器分别安装于第一油罐、第二油罐上；控制装置用于根据液位检测仪器的检测结果，控制相应阀门开启和关闭，以对第一油罐中的绝缘油进行过滤。本发明提供的绝缘油过滤系统在对绝缘油进行过滤时，无需人工进行操作，提高了滤油效率。