本发明公开了一种基于CKF的色谱峰估计方法、系统、存储介质及计算机设备，本发明提供的基于CKF的色谱峰估计方法，对色谱峰的相邻两个时刻的强度的关系进行建模，构建一个三次函数关系，能在尽可能保留色谱峰信息的前提下，最大程度地降低了计算复杂度与积分误差，其中，使用三次函数关系，积分误差为0；本发明针对色谱峰的模型，使用容积卡尔曼滤波算法(CKF)进行降噪计算，并对CKF进行了简化处理与降维处理，计算复杂度更低，更适合实时处理色谱图；本发明基于贝叶斯滤波框架进行计算，对输入参数可以灵活调整，这样能更好的适应不同色谱峰的降噪需求。