本发明公开了一种沸腾床渣油加氢系统及方法，属于渣油加氢技术领域。该系统包括萃取塔、超声波强化重力沉降器、第一汽提塔、一级和二级沸腾床加氢反应器；萃取塔顶部物料出口与超声波强化重力沉降器的入口连接；超声波强化重力沉降器底部出口与第一汽提塔的入口连接，第一汽提塔塔底出口分别与一级沸腾床加氢反应器的入口及二级沸腾床加氢反应器的入口连接；一级沸腾床加氢反应器出口与二级沸腾床加氢反应器的入口连接。该系统可在一定程度上脱除部分沥青质，同时通过加注胶质来抑制沥青质的析出和聚集，减缓了下游设备及管线的结焦情况，同时延长催化剂的使用寿命，达到延长装置运行周期并增加企业经济效益的目的。