本发明涉及污水生化处理技术领域，提供一种强化生物除磷的BioDopp生化反应系统及污水处理方法，强化生物除磷的BioDopp生化反应系统包括至少一个厌氧区、至少一个缺氧区、至少一个好氧区和沉淀区；在厌氧区内基本没有溶解氧或者硝态氮等电子受体的情况下，优质碳源由除磷菌（PAOs）以PHA或PHB的形式储存于体内，进入缺氧区之后用于反硝化反应，可以实现反硝化除磷；在污水中不能被厌氧释磷反应利用的其它碳源跟随混合液进入缺氧区进行反硝化脱氮反应，反硝化脱氮反应没法利用的碳源跟随混合液进入好氧区进行去除，部分体内存储有PHA或PHB的除磷菌（PAOs）即使因为其它原因没有发生反硝化除磷反应也会进入到后续的好氧区进行好氧吸磷反应，进一步强化生物除磷功能。