本发明提供一种分离和定量分析河滩土壤中生物可利用有机碎屑的方法。该方法主要是将从河岸滩地区域采集的土壤样品与水混合，搅动使有机碎屑悬浮，将上悬浮液依次过不同孔径的滤网获得有机碎屑；将有机碎屑投入密度为1.4g/mL的硅胶悬浮液中，静置分层，将上悬浊液用孔径0.15mm的滤网过滤，将下层混合物过滤得到密度>1.4g/mL的有机碎屑；将滤网上的有机碎屑再投入密度为1.2g/mL的硅胶悬浮液中，静置分层，将上悬浊液用孔径为0.15mm的滤网过滤，将下层混合物过滤后得到密度大于1.2g/mL且小于等于1.4g/mL的有机碎屑，滤网上的有机碎屑即为密度≤1.2g/mL的有机碎屑。本发明可实现对河滩土壤中生物可利用有机碎屑的分离提取、密度界定以及不同密度生物可利用有机碎屑的定量分析。