本发明公开了一种防渗系统HDPE膜漏洞靶向电动修补方法及系统，包括：在HDPE膜的上部和下部分别设置供电电极，通过电源将两个供电电极连接形成供电回路；向HDPE膜漏洞区域灌入设定体积的修补溶液，所述修补溶液具有设定的Zeta电位，以使得修补溶液呈现悬浮状态；为所述回路施加设定的电压，所述修补溶液中的带电颗粒能够在电场力的作用下定向迁移至HDPE膜漏洞处并排出带电颗粒聚集体中的水分，使带电颗粒能够堵住所述漏洞。本发明方法有效减少了修补的施工过程、原材料，同时简化了施工工艺要求，有利于成本控制。