本发明涉及环境微生物技术领域，特别是涉及一种复合微生物菌剂及其在沼渣高温好氧堆肥中的应用。所述复合微生物菌剂包括立陶宛地芽孢杆菌Geobacillus lituanicus G6‑1、皮特不动杆菌Acinetobacter pittii AP‑16、泛菌属Pantoea sp.BK‑PP311和嗜热地芽孢杆菌Geobacillus kaustophilus FWGK‑JYJ1。所述复合微生物菌剂用于沼渣高温好氧堆肥，能够提高堆体的最高温度，延长高温期，快速分解有机物，缩短堆肥时间，提高物料腐熟度和有机肥质量，具有较高的应用价值。