本发明公开了一种抗白斑综合征病毒药物及其在水产养殖中的应用，苦参提取物对WSSV复制具有优异的抑制率，苦参提取物的主要生物活性成分苦参碱可显著降低WSSV复制相关基因的表达，从而抑制WSSV在克氏原螯虾体内的复制，显著增强宿主免疫相关基因的表达，提高宿主抗病毒免疫反应从而达到抗病毒效果，此外，苦参碱还具有一定的预防和治疗作用。本发明为将苦参碱开发作为一种高效实用的抗WSSV药物提供了理论依据，并为今后苦参碱对其它水生动物病毒的抗病毒效果评价及作用机制研究提供有意义的参考。