本发明涉及食品生产技术领域，更具体的说是一种食品检测检测系统及其检测方法。该方法包括以下步骤：步骤一：食品加工完成后进行双轨道并行运输；步骤二：在运输过程中定期有食品被排出进行取样；步骤三：取样食品进行测定水含量，并在测定过程中食物进行单轨运输；步骤四：测定完毕后单轨运输变回双规运输，进行循环。进一步地，所述步骤三中的测定水含量分成测定组和检验组。进一步地，所述步骤三中的测定水含量分成测定组进入的食品进行85℃加热15min。具有在不影响食品正常运输下，定期进行食品取样检测的优点。