本发明公开了一种菌丝体或菌体及其应用、及利用其选育菌株的方法。所述菌丝体或菌体为在菌株发酵生产过程中的次生代谢产物生产快速增长累积阶段中末段的发酵液中获得的菌丝体或菌体。本发明获得的菌丝体或菌体在应用于耐自身代谢产物的淡紫灰链霉菌菌株选育时，筛选到中生菌素高产菌株，所述高产菌株的产业化发酵生产水平可大幅度提高，极大地降低了中生菌素产业化生产成本，为生物农药中生菌素的市场需求奠定了基础，并且满足了绿色生态农业大范围大规模飞防用药等领域的扩展使用。