本发明公开了一种基于最小成本的风光火储一体化系统配置方法及装置。该方法包括：根据全年时长内火电机组的运行状态，构建深度为K+1的完全二叉树模型；获取历史全年各预设时长的风电历史发电量、光伏历史发电量、电网历史需求量和预设约束条件，并从根节点开始依次计算每个节点的运行成本；遍历完全二叉树模型，基于二叉树的最短路径算法确定使全年累计运行成本最小的火电机组的运行状态序列，同时获取全年累计最小运行成本，并与所有设备的年均投资成本相加，得到年均投资运行成本，以对各设备进行优化配置。本公开基于二叉树最短路径算法以全年累计运行成本最小为目标确定火电机组的运行状态序列，节约了成本，提高了风、光资源利用率。