本发明涉及一个中国桔梗RPL13内参基因序列及其引物与应用，属于基因工程技术领域。所述RPL13内参基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。该RPL13基因可以做为对中国桔梗以及与其亲缘关系较近的桔梗科其它植物中的类黄酮/花青素合成途径中的色素合成相关基因在中国桔梗及其同科其它植物的蓝、紫、白3种不同花色花器官中进行基因表达谱分析研究的内参基因。也可以做为对中国桔梗及其同科其它植物中的茎、叶及蓝、紫、白3种不同花色花器官共5种不同组织部位中的目标基因进行表达谱分析研究时所用的内参基因。