本发明公开了一种基于肢端肥大症的图像数据分析方法及系统，其分析方法包括：步骤S1：获取终端上传的当前拍摄图像，对当前拍摄图像进行识别分析以获得识别出用户的当前特征信息以及身份信息；步骤S2：根据用户的身份信息搜索并筛选用户在指定时间段内对应的目标数据，其目标数据为拍摄人体外观所得的目标人体图像和/或扫描人体组织所得的目标照射图像，并对目标数据进行特征分析以获得目标特征信息；步骤S3：将目标特征信息和当前特征信息进行比对，并结合用户年龄信息生成对应的风险因子，根据风险因子计算输出风险概率。本发明可缓解现有技术中存在预测结果准确度较差的技术问题，提高风险预测准确率。