本发明提供了一种制氢系统和制氢系统的控制方法，制氢系统包括电解液储存装置、换热器、预热器、电解槽、梯级蓄热装置和冷却装置，电解液储存装置、换热器的热侧、预热器的冷侧和电解槽相连通组成反应回路；梯级蓄热装置包括至少两个放热侧，放热侧之间的输出温度不同，其中一个放热侧与预热器的热侧相连通组成预热回路，其余放热侧一一对应地接入所述加热回路；换热器的冷侧和蓄热装置的蓄热侧相连通组成蓄热回路。本发明提供的制氢系统对反应过程散发的大量无效废热进行有效储存，实现低品质热能的回收利用，并利用回收的热量对电解液进行预热，转“冷启动”为“热启动”，缩短了启动时间，提升了制氢速度和效率，节能降耗，降低运行成本。