本发明公开了一种基于氢能供电的应急电源车及其供电控制方法，包括移动车，为应急供电提供移动载体；集装箱供电装置，采用氢能供电，作为应急供电电源为负载提供第一供电功率或给底盘供电装置充电，安装在移动车上；底盘供电装置，内部设置有储能电池，用于提供低压电以及为负载提供第二供电功率并平衡集装箱供电装置的供电输出，与集装箱供电装置并联；逆变器，用于将第一供电功率和第二供电功率转化成给负载使用的交流电，分别与集装箱供电装置和底盘供电装置连接；本发明通过储能蓄电池同时供电，对集装箱供电装置的输出功率进行平衡调节，使得逆变器输出的供电电压稳定在380V，使得整体应急电源车的供电更加稳定，降低单独氢能供电的波动性。