本发明公开了一种零排放生猪养殖秸秆垫料及其制备方法，其中零排放生猪养殖秸秆垫料包括如下组分：以秸秆100质量份计，加入复合有益微生物菌剂发酵液0.1‑0.5份、水50‑150份、辅料1.3‑4.7份；所述复合有益微生物菌剂发酵液，是由包括巨大芽孢杆菌、干酪乳杆菌、粪肠球菌、植物乳杆菌、副干酪乳杆菌的发酵液混合制备而成，各菌种发酵液混合体积比为1:1:1:1:1。本发明生态垫料在解决生猪健康问题中发挥重要作用，能够分解生猪排泄粪污并合成微生物自身所需营养成分，实现粪污零排放，降低养殖场内氨、氮、VOCs等含有臭味的气体排放，实现臭气准零排放。