一种基于不同时空分辨率的归一化植被指数数据时空融合方法，将不同时空分辨率的归一化植被指数数据进行时空融合，利用基于相邻NDVI观测的噪点二次过滤和高时间分辨率的NDVI中值的噪点过滤；结合线性插值和空间过滤，对不同时空分辨率的NDVI数据进行自动化融合生成高时间高空间分辨率NDVI数据；并利用空间过滤算法消除MODIS像元边界效应，最终得到目标区域的高空间分辨率高时间分辨率NDVI数据。本发明减少后续融合处理的不确定性，不用考虑输入数据是否晴空无云；通过结合与目标像元NDVI值的接近程度和与目标像元的欧式距离，对融合的目标像元NDVI值进行校正，提高融合影像的连续性。