本发明公开了吸塑盒除尘装置及其使用方法，涉及包装设备技术领域，所述输送链绕设在机架上，所述输送链用于将吸塑盒依次输送至滚刷组件、除尘组件以及码垛组件，所述滚刷组件包括第一滚刷和第二滚刷，所述第一滚刷的转向和第二滚刷的转向相反设置；所述除尘组件设置在输送链的两侧，所述码垛组件用于将吸塑盒堆垛整齐。吸塑盒经输送链输送至滚刷组件，经第一滚刷和第二滚刷初步除尘之后输送至除尘组件进行深度除尘，第一滚刷和第二滚刷用链轮传动，由于第一滚刷和第二滚刷转向相反设置，增加磨擦阻力更加有力的松动吸塑盒顶面的顽固灰尘，便于除尘组件对吸塑盒的顶面进行除尘。