本发明公开了一种集装箱式液封气调贮藏系统及叠装方法,包括底座，底座上设有液体槽，贮藏区设置在底座中；贮藏区上端开口，贮藏区设有第一配置管道和第二配置管道，且第一配置管道和第二配置管道的末端均竖直且设置开口，第二配置管道通过附属管道连通贮藏区内腔，附属管道设有阀门，贮藏区的侧壁设有静压箱；止回阀安装在第一配置管道末端开口上，封顶液封罩置于贮藏区上方，封顶液封罩下端伸入液体槽，封顶液封罩用于液封贮藏区上端开口和止回阀外端开口；气管液封罩下端伸入液体槽,气管液封罩用于液封第二配置管道末端开口。