本发明公开了一种脑电图机数据采集有效性自动分析系统及方法，一方面引入脑电‑近红外双重检测方式，并对测量单元的结构进行改进，以适应并方便实现双重检测，另一方面，优化了脑电数据预处理方式，极大的去除了杂波污染。在进行数据校验分析时，分别针对θ波和β波，以及α波制定不同的有效性分析手段，更引入刺激机制以及人工反馈机制，从数据及行为本身两个角度对有效性进行验证，在不过多增加系统负担及成本的前提下，同时实现了多种有效性验证方式，显著提高了数据采集有效性自动分析效率及结果可信度。