一种全光纤直流电流互感器温度补偿系统及方法，系统包括：温度解调模块、电流采集模块；温度解调模块中，光源经起偏器产生两束线偏振光，经调制器初始相位调制后，沿着保偏光纤快慢轴传输至传感光纤，温度变化使两束线偏振光相位差变化；返回的两束线偏振光经检偏器后，仅快轴传输的两束线偏振光到达探测器；通过调制器调制初始相位及引入反馈相位，使两束线偏振光相位差为90°发生干涉；探测器将干涉光信号转成电信号，电子单元根据电信号解调温度信号；电流采集模块根据温度信号对电流值进行温度补偿。本发明实现温度变化准确检测，解决全光纤直流电流互感器温度补偿不一致缺陷，满足智能电网对电流测量可靠性及稳定性要求。