一种基于上下文感知计算的RNA溶剂可及性预测方法
摘要:
本发明公开了一种基于上下文感知计算的RNA溶剂可及性预测方法,包括:S1.收集PDB数据库中所有已注释三级结构信息的RNA序列组成训练集合S;S2.获取训练集合S中碱基个数为LX的RNA序列信息,并将获取的RNA序列信息记作SX;S3.搜索SX的核苷酸数据库并生成对应的MSA;S4.对MSA进行处理,生成MSA对应的FMSA;S5.根据独热编码原理将碱基编码生成SX对应的OHE;S6.生成SX对应的RSS;S7.构建上下文感知计算神经网络框架MVCADNN,并使用MVCADNN训练RNA溶剂可及性预测模型,得到训练后的RNA溶剂可及性预测模型;S8.将待预测RNA序列通过步骤S3‑步骤S6处理后,生成RNA序列对应的特征信息,并生成的特征信息输入到训练后的RNA溶剂可及性预测模型中,得到RNA溶剂可及性的预测信息。
0/0