本发明公开了一种基于气举反循环对钻孔灌注桩的二次清孔施工方法，包括如下依次进行的步骤：步骤一、施工准备；步骤二、钻进成孔及一次清孔；步骤三、钢筋笼制作与吊放；步骤四、下放导管；步骤五、插入风管并与空压机连接；步骤六、补充孔内泥浆；步骤七、二次清孔；步骤八、测孔底沉渣；步骤九、浇筑水下混凝土。风管沿着导管中心垂直下放，风管底部插入灌注桩孔内三分之二处后停止，风管顶部处于导管顶部上方200mm与空压机连接；由于风管底部插入灌注桩孔内三分之二处后停止并且风管顶部处于导管顶部上方200mm与空压机连接，解决了导管管口外冒出不会形成反循环以及沉渣扰动较小的问题，提高了二次清孔的施工效率。