本发明提供了一种综合能源系统的协调控制方法和装置，其中，综合能源系统包括由设备层和调度层构成的两层调度结构，协调控制方法包括以下步骤：构建设备层中各能源变换设备的仿真模型；基于仿真模型研究能源变换设备之间的连接特性以及不同能流的传输特征，并根据连接特性和传输特征获取能源变换设备的等效惯量延迟特性；基于仿真模型对等效惯量延迟特性进行分析以获取相应的控制策略；在电网状态发生变化时，根据控制策略对设备层中各能源变换设备进行控制，直至接收到调度层的调度信息。由此，采用两层调度结构，在电网状态发生变化时，设备层能够迅速作出响应，不必等待调度层的调度信息，从而大大提高了通信的实时性。