本发明公开了一种磁悬浮电机系统的转子位移检测装置、方法和磁悬浮电机系统，该装置包括：获取单元，获取传感器单元采集到的电压信号；所述传感器单元，具有2N个位移传感器，N为正整数；在所述传感器单元中，一个检测方向的两个位移传感器，分别布置在所述磁悬浮电机系统中磁轴承的两侧；所述2N个位移传感器，设置在所述磁悬浮系统的转子的外围，且用于采集所述传感器单元自身所在位置处的电压信号；控制单元，对所述传感器单元采集到的电压信号进行处理，得到所述磁悬浮系统的转子位移。该方案，通过将一个方向的两个位移传感器分别布置在磁轴承两侧，能够得到转子在磁轴承处的实际位移，有利于提升磁悬浮控制精度。