本发明公开了一种核酸提取仪的磁棒套安装机构，包括控制系统和一水平设置的安装框，安装框设置有供磁棒穿过的通口，安装框连接有升降组件，安装框的下方设置有用于定位放置磁棒套位置的安放工位，安装框的沿左、右侧边方向分别设置有转动轴，转动轴连接有驱动组件，转动轴上设置有承托板和卡勾件，承托板和卡勾件不处于同一径向，通过转动使承托板或卡勾件相对，以此实现按需选择手动模式或自动模式，使用灵活性高，若由于各种外界原因(磁套尺寸出现无法通过调节抓取的差异，卡勾件出现故障或者磨损严重，机械臂下降高度出现偏差等)导致无法使用自动模式取套时，则可选择手动模式进行磁棒套的安装，使得在等待维修的过程中也不耽误实验进程。