本发明涉及信息存储技术领域，具体公开了一种自动配存流水线，包括传送系统和分注系统；还包括上料系统、下料系统和传送控制系统；传送控制系统用于控制联管传输组件按照预设速度移动；上料系统包括设于传送系统上方的上料装置，上料装置包括上料盒，上料盒用于存放待上料的联管，上料装置用于将料盒内的联管放至于联管放置盘上；分注系统用于向联管放置盘上的联管注入目标液体；下料系统包括抓取组件和多个传输组件，多个传输组件用于控制抓取组件沿多个方向运动；抓取组件用于运动速度、运动方向与传输速度和传输方向相同后，抓取传输过程中的联管。采用本发明的技术方案能够提升DNA存储的通量、效率和成功率。