本发明涉及多速率子载波调制信号收、发方法和系统，其发送方法先根据光纤色散信道的零点信息，通过对比特序列进行分组和Mi阶映射，以灵活分配速率，再通过滚降升余弦滤波器对各分支进行成型滤波，以消除部分码间串扰，然后通过重采样，对成型滤波信号进行速率调整，以调整各分支的带宽，继而再通过对重采样信号进行数字上变频，实现频谱搬移，得到中心频率为fi、带宽为Bi，成功避开各信道零点位置的各子载波中频信号，最后，通过将各子载波信号相加得到多速率子载波调制信号。本发明发送方法能在灵活分配速率的同时，生成能灵活避开光纤色散信道频谱零点位置的、具有高色散容忍度的待发送信号。